Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp48Q3V0C5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp48Q3V0C5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms