Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap65Q3V0B4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cfap65Q3V0B4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms