Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap1Q3UUV5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap1Q3UUV5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms