Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28047Q3US59 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28047Q3US59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms