Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd9Q3UQU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd9Q3UQU0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brd9Q3UQU0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms