Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fcho2Q3UQN2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fcho2Q3UQN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms