Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms