Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam198bQ3UPI1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam198bQ3UPI1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam198bQ3UPI1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms