Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nhlrc4Q3UP44 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nhlrc4Q3UP44 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms