Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem253Q3UNB8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms