Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cln5Q3UMW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cln5Q3UMW8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms