Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd27Q3UMR0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd27Q3UMR0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms