Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cobll1Q3UMF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cobll1Q3UMF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms