Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Spg7Q3ULF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg7Q3ULF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms