Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf224Q3UIW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf224Q3UIW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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