Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Greb1Q3UHK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms