Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc177Q3UHB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms