Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmd8Q3UFK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmd8Q3UFK8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms