Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtpbp6Q3U6U5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms