Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3U595 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3U595 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3U595 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3U595 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3U595 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U595 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U595 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U595 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U595 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U595 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U595 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U595 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms