Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp4Q3U4B1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms