Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc174Q3U155 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc174Q3U155 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms