Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rasip1Q3U0S6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rasip1Q3U0S6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms