Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Palb2Q3U0P1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Palb2Q3U0P1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms