Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trappc9Q3U0M1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms