Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hace1Q3U0D9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hace1Q3U0D9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms