Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
InipQ3TXT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
InipQ3TXT3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
InipQ3TXT3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms