Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt1Q3TX08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt1Q3TX08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt1Q3TX08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms