Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnnm2Q3TWN3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm2Q3TWN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm2Q3TWN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms