Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc136Q3TVA9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc136Q3TVA9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms