Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3TTJ4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms