Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21440Q3TTD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21440Q3TTD8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms