Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctdnep1Q3TP92 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctdnep1Q3TP92 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctdnep1Q3TP92 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms