Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc102aQ3TMW1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms