Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf2f1Q3THK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2f1Q3THK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms