Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hddc2Q3SXD3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hddc2Q3SXD3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms