Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpm1Q2TV84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpm1Q2TV84 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpm1Q2TV84 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms