Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vax1Q2NKI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax1Q2NKI2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms