Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
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Shroom4Q1W617 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Shroom4Q1W617 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Shroom4Q1W617 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
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Shroom4Q1W617 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
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Shroom4Q1W617 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
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Shroom4Q1W617 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
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Shroom4Q1W617 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Shroom4Q1W617 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Shroom4Q1W617 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms