Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cpne9Q1RLL3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpne9Q1RLL3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cpne9Q1RLL3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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