Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VgfQ0VGU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VgfQ0VGU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VgfQ0VGU4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms