Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam83bQ0VBM2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam83bQ0VBM2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam83bQ0VBM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms