Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hif3aQ0VBL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hif3aQ0VBL6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms