Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
StumQ0VBF8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms