Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntnap5cQ0V8T7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntnap5cQ0V8T7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms