Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zc3h18Q0P678 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zc3h18Q0P678 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms