Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn2bQ0KL01 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms