Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc21bQ0HA38 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ttc21bQ0HA38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms