Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf541Q0GGX2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Znf541Q0GGX2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf541Q0GGX2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms