Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
1700061G19RikQ08EE8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
1700061G19RikQ08EE8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms